Alineamiento de secuencias usando técnicas de procesamiento en paralelo desarrollado en un cluster de computadores

Abstract

Este artículo presenta el desarrollo de un algoritmo computacional para el alineamiento de secuencias implementado en un Cluster de Computadores en la Universidad Pontificia Bolivariana Bucaramanga usando Sistema Operativo Linux y la herremienta para configuración OSCAR utilizada para el desarrollo de aplicaciones en paralelo, también muestra el desempeño del cluster al comparar archivos con diferentes tamaños y utilizando diferente cantidad de nodos de proceso This paper presents the development of a computer algorithm for sequence alignment, implemented in a computer cluster at the Universidad Pontificia Bolivariana Bucaramanga branch using Linux operating system and OSCAR configuration tool for deploying applications in parallel, also shows the performance clusters with different sizes of files to compare, that using the cluster with different amounts of processing nodes.